Autores no século XIX escreveram que uma capela a São João Batista teria sido erguida num arraial junto à foz do rio Paraíba por volta de 1630, mas que forte ressacas obrigaram os moradores a se mudarem para cerca de 3 quilômetros rio adentro, erguendo em sua margem direita outra capela ao mesmo santo nos anos 1630. Mas não achamos qualquer documento comprovando tais informes.
Tem-se que o prelado Loureiro a tornou capela rm 1644 (Almanak Laemmert, ano 1875).
Em 1674, o Rei de Portugal fez doação do território onde hoje está São João da Barra a João Correia de Sá, para ali instalar vila e igreja. E Alvará de 1674 elevou a capela ao estado de sede paroquial. O Anuário da Diocese de Campos informa que a paróquia foi criada em 1852, mas este foi o ano de construção da atual igreja matri. Em 1882 um incêndio destruiu a capela de São João Batista na parte central da igreja.
Limitava-se ao norte com a Capitania do Espírito Santo, a leste com o Oceano Atlântico e pelas mais partes com São Salvador dos Campos dos Goytacazes.
Mais tarde as divisas foram definidas como segue: com São Salvador dos Campos dos Goytacazes a oeste no sítio chamado Valetas, margem austral do rio Paraíba e pela Barra Seca, na parte boreal, entrando pelo sertão das Cacimbas e Itabapoana. Divide-se com a freguesia de São Gonçalo pelo brejo do Martinho, nos Campos do Taí, até o mar. Ao norte, dividia pelo rio Itabapoana com a freguesia de N. Sra. da Conceição de Guarapari (ES).
| Nome | Função | Período | |
|---|---|---|---|
| CAPELÃES | |||
| (desconhecidos) | |||
| VIGÁRIOS | |||
| Manuel de Bastos | 1674 | ||
| Matias Teixeira de Mendonça | 1693-1699 | ||
| Domingos de Matos | encomendado | 1702-d.1712 | |
| Antônio Furtado de Mendonça | encomendado | 1713-1714 | |
| Gabriel Pereira de Araújo Leite | 1725 | ||
| Francisco Xavier da Fonseca | 1725 | ||
| Pedro Marques Durão | 1728-1756 | ||
| Gregório de Azevedo e Sá | 1764 | ||
| José da Cruz Domingues | 1765 | ||
| Inácio da Costa Antunes | 1765 | ||
| Manuel Borges Senra | 1767 | ||
| André Duarte Carneiro | 1768 | ||
| João da Silveira Macedo | 1768 | ||
| Manuel Furtado de Mendonça (1) | 1768-d.1796 | ||
| Belchior Alves Rangel e Silva | c. 1798 | ||
| Luís Manuel Martins | encomendado | 1810 | |
| Manuel Gomes de Azevedo | 1816-d.1833 | ||
| Francisco João Crisóstomo Barreto | 1834 | ||
| Manuel Brito Coutinho | encomendado | 1834 | |
| Miguel Antunes Brito | 1835 | ||
| Joaquim Santa Ana Lamego | 1834-1835 | ||
| Francisco José Pereira Carvalho | encomendado | 1835-1844 | |
| Manuel Joaquim da Rocha Campista (2) | 1847-1874 | ||
| Ricardo Maurício de Oliveira | encomendado | 1863-1869 | |
| Joaquim da Rocha Campelo (2) | colado | 1870-1874 | |
| Manuel Luís Coimbra | encomendado | 1874-1875 | |
| José Calvosa | encomendado | 1875-1880 | |
| José Pires da Silva Almada (3) | interino | 1881 | |
| Pedro Mortula | encomendado | 1881 | |
| Raimundo da Purificação dos Santos Lemos, cônego | encomendado | 1881-1882 | |
| Antônio Domingues Valiengo | encomendado | 1883-1885 | |
| Manuel da Silva Cid | encomendado | 1885-1887 | |
| Antonio Chiaromonte | (...)-1900 | ||
| José Carlos Fernandes | 1995 | ||
(1) Consta essa data das Memórias Históricas ..., mas os livros paroquiais mostram que o vigário Durão ainda a vicariava em 1770;
(2) Possivelmente erro no nome do padre Rocha Campista. Chamado em 1871 de Joaquim da Rocha Campista;
(3) Vigário de São Sebastião, de Campos;
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